Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM25Q14258 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms