Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBE4AQ14139 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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UBE4AQ14139 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
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UBE4AQ14139 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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UBE4AQ14139 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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UBE4AQ14139 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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UBE4AQ14139 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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UBE4AQ14139 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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UBE4AQ14139 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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UBE4AQ14139 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE4AQ14139 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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