Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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PDE6HQ13956 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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PDE6HQ13956 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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PDE6HQ13956 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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PDE6HQ13956 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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PDE6HQ13956 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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PDE6HQ13956 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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