Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2H3Q13889 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2H3Q13889 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms