Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP1Q13835 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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