Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC1Q13547 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
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