Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf61Q13536 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf61Q13536 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms