Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRQ13535 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
ATRQ13535 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRQ13535 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRQ13535 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRQ13535 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRQ13535 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRQ13535 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRQ13535 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRQ13535 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRQ13535 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRQ13535 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRQ13535 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRQ13535 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRQ13535 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRQ13535 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRQ13535 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms