Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PMS2P3Q13401 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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