Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AP3B2Q13367 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3B2Q13367 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms