Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CALCOCO2Q13137 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALCOCO2Q13137 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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