Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
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NFX1Q12986 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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NFX1Q12986 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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NFX1Q12986 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFX1Q12986 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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