Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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