Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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TRAF2Q12933 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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TRAF2Q12933 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF2Q12933 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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