Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2AQ12879 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
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