Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.83
KCNMA1Q12791 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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KCNMA1Q12791 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMA1Q12791 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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