Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms