Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FMODQ06828 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FMODQ06828 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FMODQ06828 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FMODQ06828 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms