Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBQ06643 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBQ06643 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBQ06643 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBQ06643 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBQ06643 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBQ06643 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBQ06643 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBQ06643 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBQ06643 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBQ06643 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBQ06643 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBQ06643 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBQ06643 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBQ06643 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBQ06643 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBQ06643 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBQ06643 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBQ06643 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBQ06643 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms