Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms