Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EGR4Q05215 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EGR4Q05215 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms