Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACVR1Q04771 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACVR1Q04771 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms