Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms