Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPARDQ03181 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms