Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSC2Q02487 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms