Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms