Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MS4A2Q01362 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MS4A2Q01362 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms