Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F1Q01094 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F1Q01094 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms