Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms