Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms