Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VLDLRP98155 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms