Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMF1P82094 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMF1P82094 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMF1P82094 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMF1P82094 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMF1P82094 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TMF1P82094 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMF1P82094 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMF1P82094 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMF1P82094 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TMF1P82094 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMF1P82094 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMF1P82094 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMF1P82094 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TMF1P82094 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMF1P82094 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMF1P82094 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMF1P82094 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMF1P82094 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMF1P82094 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMF1P82094 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMF1P82094 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMF1P82094 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMF1P82094 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMF1P82094 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TMF1P82094 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMF1P82094 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMF1P82094 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMF1P82094 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMF1P82094 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMF1P82094 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMF1P82094 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMF1P82094 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMF1P82094 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMF1P82094 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMF1P82094 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMF1P82094 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMF1P82094 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMF1P82094 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMF1P82094 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMF1P82094 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMF1P82094 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMF1P82094 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TMF1P82094 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMF1P82094 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMF1P82094 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TMF1P82094 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMF1P82094 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TMF1P82094 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMF1P82094 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMF1P82094 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMF1P82094 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMF1P82094 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMF1P82094 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMF1P82094 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMF1P82094 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TMF1P82094 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMF1P82094 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMF1P82094 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMF1P82094 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMF1P82094 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TMF1P82094 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMF1P82094 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMF1P82094 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMF1P82094 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMF1P82094 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMF1P82094 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMF1P82094 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMF1P82094 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMF1P82094 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMF1P82094 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMF1P82094 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMF1P82094 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMF1P82094 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TMF1P82094 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMF1P82094 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMF1P82094 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMF1P82094 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMF1P82094 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMF1P82094 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMF1P82094 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMF1P82094 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMF1P82094 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMF1P82094 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMF1P82094 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMF1P82094 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMF1P82094 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMF1P82094 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMF1P82094 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMF1P82094 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMF1P82094 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMF1P82094 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMF1P82094 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMF1P82094 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMF1P82094 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMF1P82094 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMF1P82094 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMF1P82094 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMF1P82094 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMF1P82094 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms