Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CSNK2A1P68400 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms