Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL23P62829 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL23P62829 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL23P62829 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL23P62829 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL23P62829 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL23P62829 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL23P62829 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL23P62829 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL23P62829 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL23P62829 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL23P62829 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL23P62829 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL23P62829 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL23P62829 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL23P62829 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL23P62829 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL23P62829 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL23P62829 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL23P62829 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL23P62829 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL23P62829 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL23P62829 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL23P62829 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL23P62829 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL23P62829 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL23P62829 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms