Protein–RNA interactions for Protein: P62266

RPS23, 40S ribosomal protein S23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS23P62266 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS23P62266 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS23P62266 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS23P62266 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS23P62266 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS23P62266 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS23P62266 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS23P62266 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS23P62266 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS23P62266 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS23P62266 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS23P62266 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS23P62266 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS23P62266 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS23P62266 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS23P62266 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS23P62266 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS23P62266 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS23P62266 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS23P62266 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS23P62266 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS23P62266 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS23P62266 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS23P62266 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS23P62266 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS23P62266 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS23P62266 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS23P62266 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS23P62266 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS23P62266 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS23P62266 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS23P62266 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS23P62266 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS23P62266 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS23P62266 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS23P62266 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS23P62266 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS23P62266 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS23P62266 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms