Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
UFM1P61960 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UFM1P61960 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UFM1P61960 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UFM1P61960 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UFM1P61960 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UFM1P61960 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UFM1P61960 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
UFM1P61960 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UFM1P61960 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UFM1P61960 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UFM1P61960 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UFM1P61960 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UFM1P61960 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UFM1P61960 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UFM1P61960 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UFM1P61960 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UFM1P61960 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UFM1P61960 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UFM1P61960 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UFM1P61960 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UFM1P61960 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UFM1P61960 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UFM1P61960 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UFM1P61960 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UFM1P61960 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UFM1P61960 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UFM1P61960 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UFM1P61960 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UFM1P61960 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UFM1P61960 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UFM1P61960 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UFM1P61960 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UFM1P61960 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms