Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EIF4A1P60842 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EIF4A1P60842 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EIF4A1P60842 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EIF4A1P60842 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EIF4A1P60842 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF4A1P60842 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms