Protein–RNA interactions for Protein: P56470

LGALS4, Galectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS4P56470 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS4P56470 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms