Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ARFIP2P53365 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARFIP2P53365 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms