Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA4P52798 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms