Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNA2P51530 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNA2P51530 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNA2P51530 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNA2P51530 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNA2P51530 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNA2P51530 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNA2P51530 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNA2P51530 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNA2P51530 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNA2P51530 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNA2P51530 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNA2P51530 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNA2P51530 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNA2P51530 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNA2P51530 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNA2P51530 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNA2P51530 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DNA2P51530 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNA2P51530 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms