Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLK1P49759 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLK1P49759 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLK1P49759 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLK1P49759 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CLK1P49759 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLK1P49759 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLK1P49759 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLK1P49759 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLK1P49759 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLK1P49759 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLK1P49759 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLK1P49759 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLK1P49759 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLK1P49759 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLK1P49759 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLK1P49759 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLK1P49759 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLK1P49759 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLK1P49759 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLK1P49759 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLK1P49759 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLK1P49759 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLK1P49759 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLK1P49759 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLK1P49759 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLK1P49759 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLK1P49759 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLK1P49759 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLK1P49759 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLK1P49759 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLK1P49759 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLK1P49759 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLK1P49759 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLK1P49759 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLK1P49759 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLK1P49759 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CLK1P49759 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLK1P49759 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLK1P49759 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CLK1P49759 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLK1P49759 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLK1P49759 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLK1P49759 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLK1P49759 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CLK1P49759 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLK1P49759 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLK1P49759 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLK1P49759 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLK1P49759 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLK1P49759 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLK1P49759 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLK1P49759 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLK1P49759 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLK1P49759 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLK1P49759 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLK1P49759 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLK1P49759 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLK1P49759 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLK1P49759 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLK1P49759 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms