Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGM4P49221 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms