Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRB2P47870 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRB2P47870 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRB2P47870 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRB2P47870 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRB2P47870 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRB2P47870 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRB2P47870 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GABRB2P47870 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABRB2P47870 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms