Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC19A1P41440 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms