Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA7P36544 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms