Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
ATP7BP35670 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms