Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NF2P35240 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NF2P35240 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NF2P35240 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NF2P35240 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NF2P35240 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NF2P35240 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NF2P35240 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NF2P35240 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NF2P35240 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NF2P35240 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NF2P35240 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NF2P35240 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NF2P35240 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NF2P35240 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NF2P35240 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NF2P35240 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NF2P35240 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NF2P35240 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NF2P35240 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NF2P35240 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NF2P35240 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NF2P35240 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NF2P35240 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NF2P35240 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NF2P35240 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NF2P35240 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NF2P35240 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NF2P35240 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NF2P35240 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NF2P35240 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NF2P35240 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NF2P35240 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NF2P35240 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NF2P35240 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NF2P35240 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NF2P35240 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NF2P35240 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NF2P35240 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NF2P35240 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NF2P35240 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NF2P35240 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NF2P35240 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms