Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJA4P35212 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJA4P35212 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJA4P35212 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJA4P35212 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJA4P35212 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJA4P35212 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJA4P35212 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJA4P35212 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJA4P35212 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJA4P35212 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJA4P35212 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJA4P35212 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJA4P35212 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJA4P35212 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA4P35212 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA4P35212 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA4P35212 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA4P35212 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA4P35212 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA4P35212 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA4P35212 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA4P35212 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA4P35212 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA4P35212 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA4P35212 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA4P35212 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA4P35212 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA4P35212 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA4P35212 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA4P35212 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA4P35212 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA4P35212 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA4P35212 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA4P35212 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA4P35212 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA4P35212 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA4P35212 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJA4P35212 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJA4P35212 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA4P35212 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA4P35212 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA4P35212 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA4P35212 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA4P35212 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA4P35212 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA4P35212 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA4P35212 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA4P35212 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA4P35212 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA4P35212 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA4P35212 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA4P35212 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA4P35212 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA4P35212 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA4P35212 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA4P35212 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GJA4P35212 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA4P35212 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA4P35212 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA4P35212 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA4P35212 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA4P35212 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA4P35212 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA4P35212 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA4P35212 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA4P35212 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA4P35212 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA4P35212 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GJA4P35212 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA4P35212 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA4P35212 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA4P35212 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJA4P35212 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms