Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA13P31271 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms